Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
DNAJB4Q9UDY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAJB4Q9UDY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAJB4Q9UDY4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNAJB4Q9UDY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DNAJB4Q9UDY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms