Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC6Q9UBN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC6Q9UBN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC6Q9UBN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HDAC6Q9UBN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC6Q9UBN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms