Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC4Q9UBN4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC4Q9UBN4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRPC4Q9UBN4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPC4Q9UBN4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC4Q9UBN4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms