Protein–RNA interactions for Protein: Q9P278

FNIP2, Folliculin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP2Q9P278 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNIP2Q9P278 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FNIP2Q9P278 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FNIP2Q9P278 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNIP2Q9P278 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNIP2Q9P278 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms