Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSRB1Q9NZV6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MSRB1Q9NZV6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MSRB1Q9NZV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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