Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNAJC28Q9NX36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNAJC28Q9NX36 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNAJC28Q9NX36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJC28Q9NX36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAJC28Q9NX36 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms