Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAK1IP1Q9NWT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAK1IP1Q9NWT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAK1IP1Q9NWT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAK1IP1Q9NWT1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAK1IP1Q9NWT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms