Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF19AQ9NV58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF19AQ9NV58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF19AQ9NV58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF19AQ9NV58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF19AQ9NV58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms