Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC39A9Q9NUM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC39A9Q9NUM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A9Q9NUM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A9Q9NUM3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms