Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PLSCR3Q9NRY6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLSCR3Q9NRY6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLSCR3Q9NRY6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 750.3 ms