Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TLR9Q9NR96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TLR9Q9NR96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TLR9Q9NR96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TLR9Q9NR96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms