Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDLIM7Q9NR12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PDLIM7Q9NR12 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PDLIM7Q9NR12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDLIM7Q9NR12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDLIM7Q9NR12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms