Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC35C2Q9NQQ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC35C2Q9NQQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC35C2Q9NQQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC35C2Q9NQQ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC35C2Q9NQQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms