Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERVK-5Q9HDB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERVK-5Q9HDB9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERVK-5Q9HDB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms