Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD45

TM9SF3, Transmembrane 9 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF3Q9HD45 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM9SF3Q9HD45 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TM9SF3Q9HD45 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF3Q9HD45 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF3Q9HD45 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF3Q9HD45 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms