Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED20Q9H944 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED20Q9H944 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED20Q9H944 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms