Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7R0

ZNF442, Zinc finger protein 442, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF442Q9H7R0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF442Q9H7R0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF442Q9H7R0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF442Q9H7R0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF442Q9H7R0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms