Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC90BQ9GZT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC90BQ9GZT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC90BQ9GZT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms