Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YIPF3Q9GZM5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIPF3Q9GZM5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF3Q9GZM5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms