Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPESC1Q9GZL8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPESC1Q9GZL8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BPESC1Q9GZL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPESC1Q9GZL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BPESC1Q9GZL8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BPESC1Q9GZL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BPESC1Q9GZL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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