Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BARHL1Q9BZE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARHL1Q9BZE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BARHL1Q9BZE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms