Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MAP1LC3CQ9BXW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms