Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1QTNF3Q9BXJ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QTNF3Q9BXJ4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QTNF3Q9BXJ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF3Q9BXJ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF3Q9BXJ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms