Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC0

HCAR1, Hydroxycarboxylic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR1Q9BXC0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR1Q9BXC0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HCAR1Q9BXC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HCAR1Q9BXC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HCAR1Q9BXC0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms