Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C16orf70Q9BSU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C16orf70Q9BSU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C16orf70Q9BSU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C16orf70Q9BSU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C16orf70Q9BSU1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
C16orf70Q9BSU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C16orf70Q9BSU1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C16orf70Q9BSU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C16orf70Q9BSU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C16orf70Q9BSU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C16orf70Q9BSU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms