Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP2Q9BSJ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP2Q9BSJ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP2Q9BSJ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBGCP2Q9BSJ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBGCP2Q9BSJ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBGCP2Q9BSJ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms