Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC77Q9BR77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC77Q9BR77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC77Q9BR77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC77Q9BR77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms