Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRG3Q99928 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRG3Q99928 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRG3Q99928 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRG3Q99928 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRG3Q99928 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms