Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM9SF2Q99805 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF2Q99805 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM9SF2Q99805 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF2Q99805 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.9 ms