Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP4Q99727 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMP4Q99727 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMP4Q99727 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TIMP4Q99727 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TIMP4Q99727 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms