Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
ARAP1Q96P48 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
ARAP1Q96P48 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARAP1Q96P48 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
ARAP1Q96P48 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP1Q96P48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARAP1Q96P48 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP1Q96P48 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
ARAP1Q96P48 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms