Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FRMD6Q96NE9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FRMD6Q96NE9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FRMD6Q96NE9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.1 ms