Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RILPQ96NA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RILPQ96NA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RILPQ96NA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RILPQ96NA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RILPQ96NA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms