Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COG8Q96MW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG8Q96MW5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG8Q96MW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COG8Q96MW5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms