Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VCPIP1Q96JH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCPIP1Q96JH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCPIP1Q96JH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCPIP1Q96JH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPIP1Q96JH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms