Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPD52L3Q96J77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TPD52L3Q96J77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPD52L3Q96J77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TPD52L3Q96J77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms