Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITCHQ96J02 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITCHQ96J02 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITCHQ96J02 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITCHQ96J02 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITCHQ96J02 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITCHQ96J02 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITCHQ96J02 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITCHQ96J02 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITCHQ96J02 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITCHQ96J02 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITCHQ96J02 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms