Protein–RNA interactions for Protein: Q96J01

THOC3, THO complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC3Q96J01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THOC3Q96J01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THOC3Q96J01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THOC3Q96J01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THOC3Q96J01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THOC3Q96J01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms