Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC22AQ96IW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22AQ96IW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEC22AQ96IW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms