Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPL48Q96GC5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL48Q96GC5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL48Q96GC5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL48Q96GC5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms