Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23CQ96ET8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TVP23CQ96ET8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TVP23CQ96ET8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms