Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBGCP3Q96CW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBGCP3Q96CW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBGCP3Q96CW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms