Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHF21AQ96BD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHF21AQ96BD5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF21AQ96BD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF21AQ96BD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms