Protein–RNA interactions for Protein: Q96AT1

KIAA1143, Uncharacterized protein KIAA1143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1143Q96AT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA1143Q96AT1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1143Q96AT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIAA1143Q96AT1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIAA1143Q96AT1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIAA1143Q96AT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms