Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RNF34Q969K3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RNF34Q969K3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RNF34Q969K3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF34Q969K3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms