Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP13Q92995 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP13Q92995 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP13Q92995 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP13Q92995 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP13Q92995 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP13Q92995 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP13Q92995 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP13Q92995 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP13Q92995 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP13Q92995 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP13Q92995 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP13Q92995 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP13Q92995 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP13Q92995 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP13Q92995 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP13Q92995 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP13Q92995 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP13Q92995 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP13Q92995 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP13Q92995 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP13Q92995 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP13Q92995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP13Q92995 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP13Q92995 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP13Q92995 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP13Q92995 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP13Q92995 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP13Q92995 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP13Q92995 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP13Q92995 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP13Q92995 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP13Q92995 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP13Q92995 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP13Q92995 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP13Q92995 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP13Q92995 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP13Q92995 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP13Q92995 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP13Q92995 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP13Q92995 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP13Q92995 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP13Q92995 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP13Q92995 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP13Q92995 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP13Q92995 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP13Q92995 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP13Q92995 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP13Q92995 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP13Q92995 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP13Q92995 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP13Q92995 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP13Q92995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP13Q92995 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP13Q92995 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP13Q92995 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP13Q92995 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP13Q92995 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP13Q92995 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP13Q92995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP13Q92995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP13Q92995 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP13Q92995 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP13Q92995 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP13Q92995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP13Q92995 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP13Q92995 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP13Q92995 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP13Q92995 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP13Q92995 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP13Q92995 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP13Q92995 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms