Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GATA6Q92908 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GATA6Q92908 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GATA6Q92908 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GATA6Q92908 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms