Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPGAT1Q92604 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPGAT1Q92604 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPGAT1Q92604 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPGAT1Q92604 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPGAT1Q92604 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPGAT1Q92604 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPGAT1Q92604 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPGAT1Q92604 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms