Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A6Q92581 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A6Q92581 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC9A6Q92581 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC9A6Q92581 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A6Q92581 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms