Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN4Q92575 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBXN4Q92575 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBXN4Q92575 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBXN4Q92575 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBXN4Q92575 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms